Nato a Magenta (MI) il 14 luglio 1974, dopo diverse esperienze con fanzine e autoproduzioni Mirko Perniola inizia la carriera professionale sceneggiando nel 2000 fumetti didattici e serie per house organ di diverse aziende. L'anno dopo dà vita alla serie umoristica di ambientazione storica "Anno domini" e nel 2007 crea la saga fantascientifica "Star & McCoy".
La sua collaborazione con Sergio Bonelli Editore inizia nel 2005, sceneggiando prima Zagor e poi Nathan Never, del cui "Nuovo Inizio" è stato responsabile insieme a Stefano Piani nel 2012.
Ha tenuto corsi di comunicazione, fumetto, cinema e teatro in varie scuole d'Italia e ha collaborato alla realizzazione di cortometraggi animati e format televisivi. È tutt'ora particolarmente attivo con il gruppo di autori "Artigiani delle nuvole", da lui fondato all'inizio del XXI secolo.
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